民事纠纷不会留有案底，也就不会影响孩子。根据相关规定，案底一般是指被判处刑事处罚后留下的记录。而民事纠纷是基于当事人之间因为民事活动产生的人身纠纷或者财产纠纷。
法律依据
《公务员法》第二十六条
下列人员不得录用为公务员：
(一)因犯罪受过刑事处罚的;
(二)被开除中国共产党党籍的;
(三)被开除公职的;
(四)被依法列为失信联合惩戒对象的;
(五)有法律规定不得录用为公务员的其他情形的。
《刑法》第三十三条
主刑的种类如下：
(一)管制;
(二)拘役;
(三)有期徒刑;
(四)无期徒刑;
(五)死刑。