20年前,中美英日德法6国联合宣布人类基因组工作框架图绘制完成,与曼哈顿原子弹工程、阿波罗登月计划并称为20世纪人类三大科学工程的伟大计划,取得了里程碑式的成果。随着高通量测序技术的发展及基因组测序成本的不断下降,全基因组测序(Whole Genome Sequencing, WGS)的应用逐渐从科学研究转向了临床应用,全基因组测序技术在孕前、产前及遗传病辅助诊断中的应用也在不断深入。
【资料图】
在《全基因组测序在遗传病检测中的临床应用专家共识》的基础上,基信源科为进一步实现高深度全基因组检测技术在罕见病辅助诊断的应用,对包括染色体病、线粒体病、单基因病等在内的各类遗传病进行全面检测和分析,为罕见病基因诊断提供完整解决方案。
近几十年以来,分子诊断技术得到了非常蓬勃的发展,从早期的染色体核型分析技术,到现在大规模高通量平行测序,这些技术的应用也使我们对于人体的健康、疾病以及基因和疾病之间的关系,特别是在对于遗传性疾病诊断方面,也有了更深入的认识。
图1:从单基因检测到基因组检测的技术革命
遗传病种类繁多,致病原因也各不相同。致病变异的类别包括单核苷酸变异(SNVs)和小的插入缺失(InDels)、拷贝数变异(CNVs)、结构变异(SVs)、线粒体变异等。目前主流的基因检测技术,如一代测序技术、芯片技术、临床基因包或者是全外显子组测序,都有各自的优势和局限性,但都无法做到对致病变异类型的全面覆盖。
全基因组测序,覆盖区域全面,且对各种变异类型具有更高的综合检测能力。
图2:从单基因检测到基因组检测的技术革命
随着测序技术的持续发展,基因测序的费用以“超摩尔定律”的速度不断下降。National Human Genome Research Institute的数据显示,2001年,人类基因组测序成本高达9526.3万美元。近几年基因测序成本一直稳定在1000美元左右,2022年,基因测序仪企业Ultima Genomics横空出世,理论上可将全基因组测序成本从1000美元降低至100美元。
测序技术的发展及成本的下降,使全基因组测序技术具备了在临床广泛应用的基本条件。近些年有许多利用全基因组测序技术取得的科研成果,但从总体临床应用上,目前仍存在检测周期较长(一般需20个工作日以上)、检测分析效率低、数据计算与存储、价格较高(多在万元以上)等应用难点。
图3:基因测序检测成本显著下降
全基因组检测已成为目前科研常用技术手段,应用全基因组测序技术发表的相关科研文章数目已经超过50797篇,相当于从2001年人类基因组草图发布至今,平均每年都有超过2309篇WGS相关文章发表。
图4: 全基因组检测每年WGS相关文章发表
2019年2月4日,美国贝勒医学院推出了临床全基因组检测产品,可以检测点突变(SNV)、大片段缺失重复(CNV)及染色体结构变异(SV),目前尚未加入线粒体基因检测。
图5:美国贝勒医学院推出了临床全基因组检测产品
2019年6月,《全基因组测序在遗传病检测中的临床应用专家共识》在《中华儿科杂志》上刊出,明确介绍了全基因组测序在临床应用的重要性及技术规范([1])。
图6:《全基因组测序在遗传病检测中的临床应用专家共识》
基信源科&聚道科技重磅推出罕见病临床全基因组体系服务产品,将于2023年5月7日发布。该产品将为罕见病基因诊断提供完整解决方案,惠及千万罕见病患者。
届时,罕见病研究专家,国家重点研发计划首席科学家以及相关企业创始人将受邀出席,共同解读临床全基因组服务体系的价值与行业未来发展趋势。
参考文献:
1.全基因组测序在遗传病检测中的临床应用专家共识.中华儿科杂志2019年6月第57卷第6期. Chin J Pediatr,June2019, Vol.57, No.6.2.临床基因检测报告规范与基因检测行业共识探讨.中华医学遗传学杂志2018年2月第35卷第1期Chi J Med Genet, February 2018,Vol. 35,No.1
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